在麻疹的发病过程中，病变有可能波及全身脏器，因而引起并发症。多见于重症病例或营养不良，抵抗力差的孩子。重症病例多持续高热不退，皮疹透发不好，仅隐约可见或刚出即消，或为出血性皮疹，或体温突热下降。这些表现提示并发症的存在。
麻疹为呼吸道传染病，早期病变发生在上呼吸道。所以，麻疹病孩均可有流涕，咳嗽，咽痛等上呼吸道感染症状。重症患儿常见的呼吸道并发症为喉炎和肺炎。引起喉炎和肺炎的病菌可为麻疹病毒或其他病毒，更多的是细菌。一旦出现犬吠样咳嗽，声音嘶哑，吸气性呼吸困难，应考虑并发喉炎。咳嗽加重，特别是呼吸急促、呼吸困难，因缺氧而烦躁不安、口周或唇部发绀，应考虑并发了肺炎。此时，医生在孩子的胸背部可听到细小水泡音。在有条件的情况下，可以做肺部X线检查，见到典型阴影，即可确诊。
重症麻疹患儿还可并发心肌炎。患儿出现呼吸困难，烦躁不安，面色苍白，口周及唇部发绀，脉跳增快或搏动减弱，或脉律不齐、时有时无、间隔不等。平卧时呼吸困难加重，这一点是肺炎和心肌炎所致呼吸困难的重要鉴别点。因为在心肌炎时心脏可明显增大，平卧时增大的心脏压迫双肺，使肺的膨胀受到限制，致使呼吸困难症状加重。同时，平卧状态使回到心脏的血量增多，增加了原已功能衰竭的心脏负担。医生检查时，可发现心音低钝、心律不齐、心跳加快、心脏增大，X线检查可见心搏动减弱、无力、心脏增大、肺部淤血。心电图检查对心肌炎的诊断很有价值，特别是对心律不齐的孩子，可以弄清楚是什么性质的心律不齐。
脑炎也是麻疹常见的并发症。当患儿出现精神萎靡不振，烦躁不安，神志不清，惊跳和抽风。颈部发硬，用手放在孩子的脑后而将头前倾时，可感到抵抗和颈部疼痛。前胸尚未闭合的婴儿，可见局部膨隆凸起。此时，应考虑患儿并发了脑炎。做脑脊液检查，可进一步确诊。
